Il 6 gennaio, solo tre giorni dopo la sua telefonata, il Papa è venuto a farci visita. Arrivato verso le 16.15, superato l'acquedetto che segnava l'ingresso a Betlemme e dato uno sguardo a tutte le costruzioni, si è rivolto verso il parroco e gli ha detto: "Tu sei matto! - poi aggiunse - Ma queste pazzie piacciono a Dio!". È iniziata così la visita del ponteficie che ha voluto salutare uno per uno tutti i 200 figuranti che lavoravano nelle botteghe, stalle e osterie della piccola città. Con ciascuno di loro si è intrattenuto parlando e scherzando, assaggiando persino dei prodotti locali, come la ricotta preparata dai pastori e alcune ciliegie. Arrivato dai pastori, ha accettato di farsi mettere un agnellino sulle spalle come immagine del buon pastore; lui stesso all'inizio del suo pontificato aveva detto ai sacerdoti: "Questo vi chiedo: di essere pastori con 'l'odore delle percore', pastori in mezzo al proprio gregge, e pescatori di uomini".
Nonostante la Sua voleva essere una "visita privata" rivolta al Presepe Vivente, Papa Francesco non si è sottratto al voler salutare la folla che da fuori "Betlemme" aspettava sperando di poterlo salutare. Alla folla si è rivolto dicendo: "Vi ringrazio dell'accoglienza e vi ringrazio del fervore cristiano. Ringrazio questa comunità e questo bel presepe vivente, del lavoro, della catechesi. Ma ora vi dico, finisce Natale e poi? Comincia l'anno, ma Gesù sempre rimane con noi. Credete questo?" Ha chiesto ai più piccoli avviando un dialogo con loro. Dopo la loro risposta affermativa ha aggiunto: "Gesù vince il diavolo? E il diavolo ci vince a tutti noi? No! Siete bravi!" ha commentato, complimentandosi con le catechiste per la preparazione dimostrata dai bambini. Dopo aver pregato insieme un Ave Maria per i bambini, i bambini in arrivo e i nonni il Papa ha concluso con tre "evviva" finali per Gesù, Giuseppe e Maria.
Dopo circa un ora e mezza, alle 17.50, dopo aver salutato anche le persone che erano per strada, fuori dalla parrocchia, il papa è risalito in macchina per tornare in Vaticano.